Tras alguna prueba más, he redireccionado los outputs y errores del cron para que si vuelve a fallar lo sepamos…
# m h dom mon dow command
SHELL=/bin/bash
1 1 * * 1 source $HOME/.bashrc-ni; RAILS_ENV=production /home/mastodon/live/bin/tootctl media remove-orphans > /home/mastodon/mastodon.media-remove-orphans.log 2> /home/mastodon/mastodon.media-remove-orphans.log
SHELL=/bin/bash
1 1 * * 1 source $HOME/.bashrc-ni; RAILS_ENV=production /home/mastodon/live/bin/tootctl media remove > /home/mastodon/mastodon.media-remove.log 2> /home/mastodon/mastodon.media-remove.log
SHELL=/bin/bash
1 1 * * 1 source $HOME/.bashrc-ni; RAILS_ENV=production /home/mastodon/live/bin/tootctl preview_cards remove > /home/mastodon/mastodon.preview-remove.log 2> /home/mastodon/mastodon.preview-remove.log
SHELL=/bin/bash